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应该留有一部分初代火影柱间的细胞，刚好研究研究。
“大人，这里怎么办？”飞芒虹询问。
刚刚的大战虽然被双层结界护着，没有波及到外面，但结界里面却一塌糊涂，石桥被毁不说，连许多地下管道也被破坏。现在木叶忙着追查团藏的下落顾不上，但时间一久肯定会过来查看，到时候不免会发现蛛丝马迹。
“不用担心。”
飞鸟带着众人从取根提供的密道离开基地。而他们刚走不久，基地冒出了熊熊烈火，将里面的一切烧的干干净净，“根”基地的自毁禁制被启动。
其实飞鸟最担心的是使用结界的时候动静太大，引人注意，所以他尽量减轻八门出现时的震动。好在“根”的基地本身就比较偏僻，还被封闭，而木叶有点实力的忍者都在追杀团藏，所以并没有引起太多关注，等有人查看时已经被大火吞噬。
事情结束，飞鸟、红莲和空返回了训练营地，飞芒虹则直接离开木叶。至于信乐狸，飞鸟用《虚无之光》删除了他对这件事的记忆后丢出去自生自灭了。而山老鼠早在飞鸟进入基地时，就已经被飞鸟删除记忆，此时正享受着木叶的安逸生活，等待组织的再次召唤。
纲手很愤怒，被狠狠摆了一道。
当卡卡西带队追上逃往土之国的团藏队伍时才发现团藏根本不在里面。然后更可气的时，团藏施加的《舌祸根绝之印》消失了，证明团藏死了，种种迹象表明团藏之前一直隐藏在她眼皮子底下的基地里。
基地自毁，团藏真死了嘛，还是假死脱身都不好说。如果真死的话又是谁杀了他，如果是假死，那他又在谋划什么。纲手头都大了，狠狠对着协助团藏越狱的门炎、小春发了一顿脾气后免去了他们高级顾问的职务。
就连飞鸟，纲手也没放过，谁让他放弃了原有的基地，跑去什么里见山庄，现在好了，基地成了贼窝。苦逼的飞鸟只好保证马上搬回去，不给火影大人添堵。
这场风波在木叶持续了很长时间，毕竟团藏的身份在那里，如果他要对木叶不利，那木叶可能真的将要迎来一场浩劫。由于《舌祸根绝之印》被解除，关于团藏的秘密一点一点被曝光。因此有很多已经处在要害部门的团藏手下被挖了出来，能关的关，能改造的改造。而需要改造的那部分大多被调回了“根”，用纲手的话就是“自己惹的事自己收拾”。
在这场团藏叛逃风波中，受到冲击最大的就是志村一族。团藏犯了错误被关押，和团藏叛逃是两种概念，现在志村一族的处境和当年的宇智波一族面临的有过之而无不及。不过新任族长是个聪明人，或许也是见多了木叶的黑暗，如今家族顶梁柱倒了，还砸倒一片族人，他根本不敢有一点反叛的心思，直接交出了志村一族的全部力量。
纲手也不是三代，不屑做防患杀人这种事，既然志村一族没反叛，那她就不会区别对待。该处罚就处罚，该派任务派任务，不欺负你也不哄着你，一切照旧。志村一族很快稳定了下来，但壁虎断尾还是很痛的，大批族中精英被调配到了飞鸟手下，包括失去双腿的洋子。
志村族长也是有自己的考量，洋子虽然失去了双腿，但封印出众，不是累赘。最主要是洋子是团藏的直系后代，留在家族中肯定会备受冷眼，还不如交给曾经的好友飞鸟照看呢。
两年多，洋子第一次来到小野的墓前，哭的悲痛欲绝。但那哭声中没有报仇后的释然，而是无尽的苦楚。毕竟一方是爱人，一方是祖父，如今俩人都死了，只留下她一个，恨也不是爱也不是。
洋子最后哭晕在了小野墓前，飞鸟轻轻把她抱回轮椅后看着小野墓碑，“兄弟，这次我帮你拿主意了，就让洋子忘了这一切吧。”
说完，飞鸟拿出了开启洋子记忆封印的徽章钥匙，按进了小野的墓碑里，就让洋子的这段记忆永远陪着小野沉眠。
安顿好洋子，飞鸟又将一起的空送出木叶。
小野的仇报了，空要返回南火寺完成剩下的修行。这次战斗让空认清了自己的不足，最后尽然连插手的机会都没有，他还需要继续努力。